Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SH3BP4Q9P0V3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SH3BP4Q9P0V3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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