Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG3Q9NT62 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG3Q9NT62 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms