Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MMP26Q9NRE1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms