Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms