Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL4Q9C0H6 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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