Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SSBP4Q9BWG4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms