Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PAGR1Q9BTK6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms