Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HERPUD2Q9BSE4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms