Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GORASP1Q9BQQ3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GORASP1Q9BQQ3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296 ms