Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLF1Q9BQI6 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms