Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HINFPQ9BQA5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HINFPQ9BQA5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms