Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRIQ1Q96JM4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRIQ1Q96JM4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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