Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK5RAP3Q96JB5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms