Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM12Q96EX1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms