Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HPS3Q969F9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms