Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKD2Q969F2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NKD2Q969F2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms