Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GTF3C6Q969F1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GTF3C6Q969F1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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GTF3C6Q969F1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GTF3C6Q969F1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
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