Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TOPBP1Q92547 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOPBP1Q92547 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms