Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ETNK1-201ENST00000266517 7159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RNF144B-201ENST00000259939 5036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AR-203ENST00000396044 10221 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 RGPD8-203ENST00000409750 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 BACH2-210ENST00000537989 9108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
COPS9Q8WXC6 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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