Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRRN4Q8WUT4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms