Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCDC12Q8WUD4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms