Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UBA3Q8TBC4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBA3Q8TBC4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms