Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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