Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KCNMB4Q86W47 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KCNMB4Q86W47 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms