Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SYT9Q86SS6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms