Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NLRP9Q7RTR0 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms