Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms