Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CNNM4Q6P4Q7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CNNM4Q6P4Q7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms