Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PRRT3Q5FWE3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms