Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SGO1Q5FBB7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms