Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALFQ53S48 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms