Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TTLL13P-206ENST00000641754 2256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 XPC-201ENST00000285021 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 DNMT3A-201ENST00000264709 9501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZIC4-217ENST00000525172 4152 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TSPEAR-204ENST00000614657 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 UHRF1-206ENST00000622802 3230 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 DCT-202ENST00000446125 2395 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC14L2-214ENST00000615189 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 FOSB-210ENST00000591858 3658 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 NDST1-201ENST00000261797 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF423-204ENST00000562520 4018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
KRTAP25-1Q3LHN0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms