Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDO1Q16878 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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