Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SGCAQ16586 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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