Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RPE65Q16518 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RPE65Q16518 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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