Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRKQ15262 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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