Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
POLD3Q15054 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms