Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAP1Q15027 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAP1Q15027 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.8 ms