Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NWD1Q149M9 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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