Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RFTN1Q14699 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RFTN1Q14699 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RFTN1Q14699 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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RFTN1Q14699 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RFTN1Q14699 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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RFTN1Q14699 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RFTN1Q14699 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RFTN1Q14699 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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RFTN1Q14699 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RFTN1Q14699 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RFTN1Q14699 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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RFTN1Q14699 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RFTN1Q14699 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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