Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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