Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CBFBQ13951 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms