Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms