Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HTR4Q13639 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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HTR4Q13639 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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HTR4Q13639 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HTR4Q13639 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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