Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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CDH18Q13634 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDH18Q13634 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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