Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MKRN4PQ13434 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC008592.3-201ENST00000514941 418 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C14orf159-210ENST00000518665 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LYVE1-203ENST00000529598 936 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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MKRN4PQ13434 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL445072.1-201ENST00000438994 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL928921.1-201ENST00000441033 708 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RNASEH2B-AS1-201ENST00000454605 1007 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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