Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CLN3Q13286 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms