Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms