Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRJQ12913 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRJQ12913 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRJQ12913 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms