Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC10A2Q12908 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms